בגיל 35.5 אייל משומר החליט לפרוש מכדורגל.
המגן הימני הגיע למכבי חיפה מהפועל כפר סבא, בתחילת עונת 06/07 והפך עם השנים לבורג מרכזי בהצלחות של הקבוצה בשלהי העשור הקודם.
כבר בעונתו הראשונה בקבוצה, העפיל משומר עם מכבי חיפה לשמינית גמר גביע אופ"א. בהמשך זכה השחקן עם המועדון בשתי אליפויות וזכה להעפיל עם המדים הירוקים לשלב הבתים של ליגת האלופות. משומר גם היה שותף לזכייה בתואר האחרון בו זכתה הקבוצה, גביע המדינה ב-2016.
משומר שיחק במכבי חיפה 10 עונות, במהלכן רשם 233 הופעות ליגה, 23 בגביע ו-39 הופעות באירופה. משומר כבש במדים הירוקים 19 שערים, אחד מהם זכור במיוחד, בדקה ה-89 מול הפועל פתח תקווה, שער שבעצם סלל את דרכה של מכבי חיפה לאליפות. למגן הימני האגדי גם 10 הופעות במדי נבחרת ישראל.
ניר דוידוביץ', ששיחק איתו במשך שנים, אמר הערב לאתר הרשמי: "שמחתי לשתף פעולה עם אייל במכבי חיפה במשך שנים רבות. אחד המגנים הטובים שהיו בכדורגל הישראלי. אני מאחל לו המון בהצלחה בהמשך הדרך". 
גוסטבו בוקולי אמר: "היה כיף להיות חלק מקריירה של מגן ובנאדם כל כך חשוב לכדורגל הישראלי. היה לי כבוד גדול להיות חלק מהקריירה שלו".